Los temas de investigación que desarrolla el PROPEEs se vinculan a la Ingeniería de Estructuras. Estos temas se reparten en líneas de investigación distribuidas en dos grupos denominados A y B.

La división en dos grupos busca reunir perfiles diferentes de alumnos. En el grupo A, los alumnos son oriundos de pregrados en ingenierías con fuerte formación en Estructuras, tales como Ingeniería Civil, Mecánica, Aeronáutica, Aeroespacial. Durante la duración del programa, los estudiantes, además de realizar investigación dentro de la Ingeniería de Estructuras, deben cursar asignaturas obligatorias compatibles con su pregrado. En el grupo B, el origen de los alumnos es distinta del grupo A. Por ejemplo, puede ser formado por profesionales de arquitectura, salud, ciencias exactas y computación. Estos estudiantes deben cursar asignaturas obligatorias que les posibiliten lograr un nivel mínimo de conocimiento en Estructuras, con el fin de que sean capaces de contribuir en investigaciones que tocan con las demás áreas de conocimiento.

Grupo A

- Estructuras de Hormigón Armado y Albañilería;
- Estructuras de Madera;
- Estructuras de Acero y Estructuras Compuestas de Acero y Hormigón;
- Mecánica de Estructuras y Materiales;
- Métodos Numéricos y Computacionales.

Grupo B

- Biomecánica;
- Métodos Numéricos y Computacionales;
- Nuevas Tecnologías y Metodologías para la Enseñanza de la Ingeniería;
- Sistemas constructivos.