Além da infraestrutura de informática, o Programa dispõe dos seguintes laboratórios:
- Laboratório de Análise Experimental de Estruturas (LAEES), no qual são realizados ensaios em escala real. Esse laboratório possui duas placas de reação e todos os equipamentos necessários à execução confiável de ensaios, atendendo as pesquisas de estruturas de concreto armado, de aço, de madeira, de alvenaria e mistas.
- Laboratório de Dinâmica e Acústica Estrutural - LADAE.
- Centro Avançado de Pesquisa da Madeira, Móveis e Novos Materiais (CEPAM3), complexo incluindo o Laboratório de Anatomia e Características Físicas da Madeira, Laboratório de Caracterização Mecânica da Madeira, Derivados e Novos Materiais, Laboratório de Avaliação da Conformidade de Móveis, Laboratório de Ensaios Não-Destrutivos e Laboratório de Avaliação de Desempenho de Componentes Construtivos.
- Laboratório de Engenharia Biomecânica -
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- Novo LAEES - Laboratório de Análise Experimental de Estruturas
- Laboratório de Engenharia de Segurança Contra Incêndio e Ligth Steel Frame - LINCE FRAME
- Laboratório INSANE -
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